日本国会1990年通过迁都的决议，1992年正式通过《关于迁移国会等的法律》。但此时，日本泡沫经济已经形成，经济增速减缓，内阁不得不于1997年决定冻结开工计划3年。
1999年，日本国土厅官员表示，地址选定之后，一个占地2000公顷、容纳10万居民的“国会城”将首先动工，此外还要兴建一些能容纳3万至10万人的“卫星城”。3个可能入选的城市开始了紧锣密鼓的宣传。整个迁都计划将耗资1050亿美元，但分析家估计，最终造价可能高达3500亿美元。
二战结束时，东京人口为278万，城市型土地利用大致在半径10公里左右的范围内。随着战后经济复兴，以东京为中心的城市型土地利用急剧扩张。1997年东京都核心区达到625平方公里，后来东京向东扩展到千叶和东南横滨一带后，显得大东京舒展多了。现在据统计，大东京都市圈17200平方公里内已经集聚了大约3258万人，占全日本人口的25.9%。东京城市的单核心结构导致中心区的地价急剧上升，而当局迟迟不下决心实施功能分解。东京1959年的城市发展战略，确定了绿带加卫星城的“一极集中”模式，失控后又调整为“多心多核”模式，无效后1987年又提出构筑“多中心分散型”国土结构的构想，但遭到单核心模式受益者东京都地方政府的抵制。
2001年东京都政府用自己的方法对迁都费用做了一次预算，总额是国会等迁都都审议会提出的推测费用的1.6倍，高达20兆亿日元。东京都政府指出，把首都机能分散开去，并不会达到预期的效果。东京都知事甚至称，把政府迁出作为国家政权中心400多年的东京，是对“历史的亵渎”。但是，更有专家认为：当日本国会搬至东京城外60至100公里处建立新的国家行政中心时，那么，东京都市圈就会在拥有神奈川、千叶、崎玉三县之外，再加上山梨、群马、厉木和茨城四县，最终形成一都七县，怀拥大海的4176万人口的国际最大都市圈。也有许多赞成的人认为：东京太拥堵了，各项办公成本太高，如果搬到东京外围60公里处的地价将比市中心低近100倍，这对新区开发商来讲是个十分利好的消息。
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